Özel sektörde dershane, ilköğretim okulları ve anaokulunda psikolojik danışmanlık, yöneticilik yaptı. Aynı zamanda çalıştığı kurumlarda kurumsal vizyon danışmanlığı yaptı. EFT uygulamaları yapan Aybek, European & Middle Eastern Institute of Hypnosis (EMEIH)’den uygulamalı NLP Hipnoz Practicioner (Hipnotist) eğitimi aldı. Anne baba çocuk eğitimi, dikkat gelişimi, meslekler, etkili öğrenme ve çalışma alışkanlıkları üzerine yayınları olan Mürşid Ekmel Aybek, aynı zamanda çeşitli çocuk eğitimi kitaplarına pedagojik danışmanlık yapmaktadır. Çocuk eğitimi ve özellikle çocuğun Karakter ve Fıtrat Gelişimi üzerine çalışmaları bulunmaktadır. Amerika Birleşik Devletlerinde Karakter Eğitimi, Osmanlı ve Selçuklu’da çocuk eğitimi, Cumhuriyet’imizin ilk yıllarında çocuk eğitimi üzerine araştırmalar yapmaktadır.
“Resim ve Yazıyla Bilinçaltı Analizi” metodolojisi ile çocuğun/gencin (7-14 yaş) gerçek performansının ortaya çıkması amacıyla “Çocuğun Mevcut Psikolojik Durumunun Tespiti” ve temel ihtiyaçlar konusunda ailelere danışmanlık yapmaktadır. Çocuk ve Zeka Gelişimi, Özel/Üstün Yetenekli Çocuklar ve Zeka Materyalleri üzerine araştırmalar ve uygulamalar yapmakta, çocuğun zeka gelişiminde yöntemler ve teknikler konusunda eğitimler vermektedir.
ZEKAM Zeka, Kavrama, Akıl, Mantık Gelişim Programına (özel/üstün yetenekli çocuklar eğitim programı) danışmanlık yapan Aybek, öğrencilere, öğretmenlere, ailelere, ilköğretim ve anaokullarına, Yapılandırmacı Yaklaşım Felsefesi ve Uygulamaları, Çocuğun Karakter ve Fıtrat Gelişimi konusunda danışmanlık yapmakta, eğitimler vermektedir. 2012 yılında Eğitim Politikaları ve Araştırmaları Derneğini kurdu eğitim araştırmalarına dair çalışmalarını ekip arkadaşlarıyla birlikte dernek çatısı altında sürdürmektedir. Sosyal Politkalar Derneği Yönetim Kurulu üyesidir. Evli ve üç çocuk babasıdır.